Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ACACAQ13085 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms