Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms