Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms