Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TRHP20396 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF136-201ENST00000343979 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TRHP20396 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms