Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C8orf49Q96NF6 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms