Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40Q6AI12 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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