Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FCAR-207ENST00000391725 830 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 REG3A-202ENST00000393878 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP136-201ENST00000410927 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC064862.3-201ENST00000411435 571 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC018638.1-201ENST00000414464 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC118555.1-201ENST00000426386 696 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPLP1P13-201ENST00000434567 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL138957.1-201ENST00000435156 342 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL355149.1-201ENST00000438396 882 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IFITM4P-207ENST00000441380 420 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC002366.1-201ENST00000446186 1190 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IGLV7-35-201ENST00000523314 340 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC105206.2-201ENST00000523556 515 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF548-207ENST00000597400 589 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LGALS17A-205ENST00000598736 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CHCHD2P11-201ENST00000604283 457 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L17P-201ENST00000611297 586 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FAM74A4-202ENST00000618177 469 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC127381.3-201ENST00000622901 303 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms