Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms