Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms