Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ALCAMQ13740 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ALCAMQ13740 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ALCAMQ13740 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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