Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms