Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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TCIRG1Q13488 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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