Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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