Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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