Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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