Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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VPS72Q15906 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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VPS72Q15906 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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