Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms