Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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