Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL4A6Q14031 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL4A6Q14031 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL4A6Q14031 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL4A6Q14031 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL4A6Q14031 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL4A6Q14031 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL4A6Q14031 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL4A6Q14031 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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