Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ALCAMQ13740 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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