Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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