Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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