Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NME3Q13232 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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NME3Q13232 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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