Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXC13P31276 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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