Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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