Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms