Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD2Q9UKL4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJD2Q9UKL4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms