Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms