Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms