Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms