Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms