Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
STRN4Q9NRL3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRN4Q9NRL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms