Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX2Q9NRD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms