Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM5Q9NQX1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM5Q9NQX1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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