Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms