Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP1Q9C000 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms