Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms