Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR2Q9BYE9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms