Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms