Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms