Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF4

CCDC140, Coiled-coil domain-containing protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC140Q96MF4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC140Q96MF4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC140Q96MF4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms