Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms