Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNRQ92752 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRQ92752 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRQ92752 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRQ92752 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRQ92752 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRQ92752 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRQ92752 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRQ92752 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRQ92752 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms