Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FAT3Q8TDW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FAT3Q8TDW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FAT3Q8TDW7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FAT3Q8TDW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FAT3Q8TDW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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