Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00301Q8NCQ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms