Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP50Q70EL3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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