Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP34Q70CQ2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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