Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms