Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms