Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL2Q6F5E8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms